Мыналар:
Жоғары Еуразиялық экономикалық кеңес;
Еуразиялық үкіметаралық кеңес;
Еуразиялық экономикалық комиссия;
Еуразиялық экономикалық одақтың Соты Еуразиялық экономикалық одақтың органдары болып табылады.
Жоғары Еуразиялық экономикалық кеңес (Жоғары кеңес, ЖЕЭК) Одаққа мүше мемлекеттердің басшыларынан тұратын Одақтың жоғары органы болып табылады. Жоғары кеңес Одақ қызметінің қағидаттық мәселелерін қарайды, интеграцияны дамыту стратегиясын, бағыттары мен перспективаларын айқындайды және Одақтың мақсаттарын іске асыруға бағытталған шешімдер қабылдайды.
Жоғары Еуразиялық экономикалық кеңестің шешімдері және өкімдері консенсуспен қабылданады. Мүше мемлекеттер Жоғары кеңестің шешімдерін өз ұлттық заңнамасында көзделген тәртіппен орындауға тиіс.
Жоғары кеңестің отырыстары жылына кемінде 1 рет өткізіледі. Одақ қызметінің кейінге қалдыруға болмайтын мәселелерін шешу үшін кез келген мүше мемлекеттің немесе Жоғары кеңес Төрағасының бастамасы бойынша Жоғары кеңестің кезектен тыс отырыстары шақырылуы мүмкін.
Еуразиялық үкіметаралық кеңес (Үкіметаралық кеңес) Одақтың мүше мемлекеттер үкіметтерінің басшыларынан тұратын органы болып табылады. Үкіметаралық кеңес Еуразиялық экономикалық одақ туралы шартты, Одақ шеңберіндегі халықаралық шарттарды және Жоғары кеңестің шешімдерін іске асыруды және орындалуын бақылауды қамтамасыз етеді; Комиссия Кеңесінің ұсынысы бойынша консенсусқа қол жеткізілмеген мәселелерді қарайды; Комиссияға тапсырмалар береді; сондай-ақ ЕАЭО туралы шартта және Одақ шеңберіндегі халықаралық шарттарда көзделген өзге өкілеттіктерді жүзеге асырады. Еуразиялық үкіметаралық кеңестің шешімдері және өкімдері консенсуспен қабылданады және мүше мемлекеттердің өз ұлттық заңнамасында көзделген тәртіппен орындалуы тиіс.
Үкіметаралық кеңестің отырысы қажет болуына қарай, бірақ кемінде жылына 2 рет өткізіледі. Одақ қызметінің кейінге қалдыруға болмайтын мәселелерін шешу үшін кез келген мүше мемлекеттің немесе Үкіметаралық кеңес Төрағасының бастамасы бойынша Үкіметаралық кеңестің кезектен тыс отырыстары шақырылуы мүмкін.
Еуразиялық экономикалық комиссия Одақтың тұрақты жұмыс істейтін реттеуші органы болып табылады. Комиссия Кеңестен және Алқадан тұрады. Комиссия нормативтік-құқықтық сипатқа ие және мүше мемлекеттер үшін міндетті шешімдерді, ұйымдастырушылық-өкімдік сипатқа ие өкімдерді және міндетті сипатқа ие емес ұсынымдарды қабылдайды. Комиссияның шешімдері Одақ құқығына кіреді және мүше мемлекеттердің аумақтарында тікелей қолдануға жатады.
Еуразиялық экономикалық комиссия Кеңесінің шешімдері, өкімдері және ұсынымдары консенсуспен қабылданады. ЕЭК Алқасының шешімдері, өкімдері және ұсынымдары айқын басым көпшілік дауыспен (Алқа мүшелерінің жалпы санының 2/3 дауысы) немесе консенсуспен (тізбесін ЖЕЭК айқындайтын әсер ететін мәселелер бойынша) қабылданады.
Комиссия Мәскеуде орналасқан.
Еуразиялық экономикалық одақтың Соты Еуразиялық экономикалық одақтың тұрақты жұмыс істейтін сот органы болып табылады.
Сот қызметінің мақсаты мүше мемлекеттер мен Одақ органдарының Еуразиялық экономикалық одақ туралы шартты, Одақ шеңберіндегі халықаралық шарттарды, Одақтың үшінші тараппен халықаралық шарттарын және Одақ органдарының шешімдерін біркелкі қолдануын қамтамасыз ету болып табылады. Сот мүше мемлекеттің не шаруашылық жүргізуші субъектінің өтініші бойынша ЕАЭО туралы шартты, Одақ шеңберіндегі халықаралық шарттарды және (немесе) Одақ органдарының шешімдерін іске асыру мәселелері бойынша туындайтын дауларды қарайды. Мүше мемлекеттің арызы бойынша дауларды қарау нәтижелері бойынша Сот дау тараптарының орындауы үшін міндетті болып табылатын шешім шығарады. Шаруашылық жүргізуші субъектінің арызы бойынша дауларды қарау нәтижелері бойынша Сот Комиссияның орындауы үшін міндетті болып табылатын шешім шығарады.
Сот құрамына әрбір мүше мемлекеттен Жоғары Еуразиялық экономикалық кеңес мүше мемлекеттердің ұсынысы бойынша лауазымға тоғыз жыл мерзімге тағайындайтын екі судья кіреді. Сот істерді Соттың Үлкен алқасының, Сот Алқасының және Соттың Аппеляциялық палатасының құрамында қарайды.
ЕАЭО Соты Минскіде орналасқан.